Modulul cuprinde trei cursuri, susținute de Dr. Onda-Tabita Călugăru, la momentul susținerii cursului medic specialist Genetică Medicală, doctorand, activând în cadrul Institutului Clinic Fundeni.

• Adnotarea variantelor identificate
• Principii de raportare a variantelor
• Baze de date

Primul curs este dedicat adnotării variantelor genetice, explicând fluxul complet de la datele brute NGS — FASTQ, VCF — la o variantă interpretabilă. Sunt detaliate standardele internaționale de nomenclatură HGVS, HGNC și RefSeq, descrierea corectă a tipurilor de variante, diferențele dintre coordonatele genomice și cele de transcript, adnotarea variațiilor de număr de copii și erorile frecvente în nomenclatură. Este subliniată importanța utilizării instrumentelor validate — Mutalyzer, VariantValidator — pentru asigurarea reproductibilității și evitarea erorilor cu impact clinic, etic și legal.

Al doilea curs abordează raportarea standardizată a variantelor NGS, definind raportul NGS ca document medical interpretat și nu ca rezultat tehnic brut. Sunt prezentate clasificarea variantelor germinale conform criteriilor ACMG — P, LP, VUS, LB, B — și clasificarea variantelor somatice conform sistemului AMP/ASCO/CAP în 4 Tiers, gestionarea variantelor VUS, raportarea variantelor acționabile, descoperirile secundare și incidentale, precum și limitările tehnice ale testării NGS. Este evidențiat rolul esențial al colaborării multidisciplinare dintre hematolog, genetician, bioinformatician și patolog.

Al treilea curs prezintă bazele de date genomice ca instrumente de suport în interpretarea variantelor NGS, analizând în detaliu ClinVar, gnomAD, Ensembl, ClinGen și OncoKB — rolul, specificul și limitările fiecăreia. Este subliniată importanța diferențierii între genomica germinală și cea somatică, precum și necesitatea corelării informațiilor din bazele de date cu datele clinice, citogenetice și moleculare pentru evitarea interpretărilor eronate.

Împreună, cele trei cursuri oferă o abordare sistematică și standardizată a interpretării rezultatelor NGS, de la descrierea tehnică a variantelor până la decizia clinică finală, constituind un cadru esențial pentru practica modernă în oncogenetică și hematologie moleculară.